Hornborgasjön drabbades av fem sänkningar, de två sista under 1900-talet fick förödande effekter. Men mycket mer åkermark blev det inte eftersom vårfloderna fortfarande var alltför stora för att det skulle gå att odla marken. Sjön växte istället igen med buskar och vass, det blev ett träsk.
I mitten av 1980-talet påbörjades en unik restaurering för att återskapa en bra fågelmiljö. Vass frästes bort med specialbyggda amfibiemaskiner, strandskog avverkades och kanaler lades igen. För att kunna höja vattenståndet med i genomsnitt 85 cm byggdes en tre kilometer lång vall på sjöns västra sida. Därefter höjdes sjön i tre etapper. Hösten 1992 påbörjades vattenhöjningen och den var avslutad våren 1995.
Sjön är nu ca 30 kvadratkilometer stor och med ett största djup på 2 meter under våren. Vattenståndet kan variera något år från år. Nu finns det ordentligt med vatten i sjön året runt och fåglarna har kommit tillbaka i stora mängder. Arter som försvann vid seklets början häckar åter i sjön. Hornborgasjön har blivit ett fågelparadis igen.